高科大育成中心為學校一級單位（校級研究中心）， 於86年獲經濟部中小企業處補助設立，係第一批獲准設立大專校院育成中心之一。
層級架構如下：
>> 校長、副校長
> 工學院
> 管理學院
> 外語學院
> 通識教育委員會
> 創新育成中心 、水資源保育及發展研究中心、能源科技研究中心
育成中心架構如下圖所示，以中心主任為中心負責人，其下分為輔導專家顧問群及諮詢委員會，中心業務分別由專案經理和專案副理執行相關業務。
層級架構如下：
>> 中心主任 - 林柏村 主任
> 創新組 > 專案經理 - 劉錦鴻 經理
> 創業組 > 專案副理 - 郭小萍 經理
